日本人执行焦土计划，需要占用羊肉胡同的一处宅子，那里是日本人当年的细菌研究所，小林觉的研究成果还藏在那里的密道中，为了得到这处宅子，日本人再次约见了杜嘉兴，而杜嘉兴此刻也急需日本人帮忙，于是一拍即合。
徐德庸设下埋伏准备将暗害自己的力量消灭，不料带人来杀他的竟然是徐根生。原来徐根生早就觊觎帮主之位，想要篡夺位置，他鼓动几个有野心的分舵主出面叛乱，却被徐德庸无情粉碎。徐德庸带着徐根生，途中却被老幺带人拦截，他们开枪打死徐根生，劫走了徐德庸。
他们在徐德庸随身携带的箱子里没有发现那份戴笠证据，于是关押起他来，胁迫他交出证据。
神枪手分集介绍 第22集彭克虎想老幺表明心际，说服她释放徐德庸，他们匆忙赶到关押徐德庸的地方，却发现徐德庸刚刚被胡晨光带走。
彭克虎找胡晨光要人，胡晨光逼彭克虎交出证据---那些证据早就被徐德庸转移给了彭克虎。彭克虎准备拿证据换人，林家山则出面阻止，建议他让胡晨光彻底暴露。他们设计保住了证据，救出了徐德庸，看完了那些证据，林家山很痛苦，他心目中的军统形象再次蒙尘。
徐德庸其实已经和重庆派来的特使廉主任建立了练习，廉主任受命调查军统内部有人涉嫌伤害徐德庸的案子，徐德庸让他亲眼看到了胡晨光和杜嘉兴对自己的迫害，廉主任出面扣押了这两个人。
老幺为救胡晨光，冒险潜入八办偷那些证据，却被抓住，彭克虎向刘主任求情放了她。不料等老幺回到家，却发现胡晨光为保住自己的位置，已经做好了和老幺一刀两断划清界限的准备，老幺很伤心。在杜嘉兴帮助下，日本人进了羊肉胡同，拿到了以前培养的菌苗，为了试验菌苗的活性，他们在一具被他们杀死的中国人身上布下了菌苗，很快蔓延起来，由于有强烈传染性，羊肉胡同被全面封锁起来。
