1、营养不良初期，身高并无影响，但随着病情加重，骨骼生长减慢，身高亦低于正常。轻度营养不良，精神状态正常，但重度可有精神萎靡，反应差，体温偏低，脉细无力，无食欲，腹泻、便秘交替。合并血浆白蛋白明显下降时，可有凹陷性浮肿、皮肤发亮，严重时可破溃、感染形成慢性溃疡。重度营养不良可有重要脏器功能损害，如心脏功能下降可有心音低钝，血压偏低，脉搏变缓，呼吸浅表等。
2、由于营养不良的患儿免疫功能低下，故易患各种感染，如反复呼吸道感染、鹅口疮、肺炎、结核病、中耳炎、尿路感染等；婴儿腹泻常迁延不愈加重营养不良，形成恶性循环。营养不良可并发自发性低血糖，患儿可突然表现为面色灰白、神志不清、脉搏减慢、呼吸暂停、体温不升但无抽搐，若不及时诊治，可致死亡。
3、重度营养不良可有重要脏器功能损害，如心脏功能下降，可有心音低钝，血压偏低，脉搏变缓，呼吸浅表等。常见的并发症有营养性贫血，可有多种维生素缺乏，约有3/4的病儿伴有锌缺乏，由于免疫功能低下，故易患各种感染病。同时，婴幼儿时期是生长发育速率最快的发育关键阶段，缺乏蛋白质和能量对其生长的影响是致命的。婴儿营养不良可导致免疫功能受损，增加疾病易感性和疾病死亡率。
